Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDR2Q01850 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms