Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
IRF9Q00978 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF9Q00978 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms