Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDC42EP1Q00587 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms