Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC5Q00444 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms