Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms