Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSNK2BP67870 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK2BP67870 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK2BP67870 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK2BP67870 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK2BP67870 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK2BP67870 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK2BP67870 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK2BP67870 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK2BP67870 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK2BP67870 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK2BP67870 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK2BP67870 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK2BP67870 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK2BP67870 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK2BP67870 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK2BP67870 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK2BP67870 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK2BP67870 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK2BP67870 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK2BP67870 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK2BP67870 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK2BP67870 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK2BP67870 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK2BP67870 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK2BP67870 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSNK2BP67870 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSNK2BP67870 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSNK2BP67870 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSNK2BP67870 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSNK2BP67870 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSNK2BP67870 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSNK2BP67870 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSNK2BP67870 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSNK2BP67870 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSNK2BP67870 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSNK2BP67870 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSNK2BP67870 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSNK2BP67870 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSNK2BP67870 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSNK2BP67870 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSNK2BP67870 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSNK2BP67870 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSNK2BP67870 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSNK2BP67870 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSNK2BP67870 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSNK2BP67870 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSNK2BP67870 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSNK2BP67870 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSNK2BP67870 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSNK2BP67870 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSNK2BP67870 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSNK2BP67870 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSNK2BP67870 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSNK2BP67870 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSNK2BP67870 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSNK2BP67870 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSNK2BP67870 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSNK2BP67870 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms