Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms