Protein–RNA interactions for Protein: P61962

DCAF7, DDB1- and CUL4-associated factor 7, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF7P61962 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCAF7P61962 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms