Protein–RNA interactions for Protein: P58304

VSX2, Visual system homeobox 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2P58304 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VSX2P58304 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VSX2P58304 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VSX2P58304 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VSX2P58304 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VSX2P58304 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VSX2P58304 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VSX2P58304 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VSX2P58304 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VSX2P58304 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VSX2P58304 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VSX2P58304 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VSX2P58304 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VSX2P58304 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VSX2P58304 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VSX2P58304 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VSX2P58304 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VSX2P58304 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VSX2P58304 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VSX2P58304 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VSX2P58304 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VSX2P58304 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VSX2P58304 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VSX2P58304 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VSX2P58304 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VSX2P58304 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VSX2P58304 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VSX2P58304 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VSX2P58304 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VSX2P58304 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VSX2P58304 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VSX2P58304 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VSX2P58304 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VSX2P58304 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VSX2P58304 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VSX2P58304 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VSX2P58304 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VSX2P58304 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VSX2P58304 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VSX2P58304 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VSX2P58304 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VSX2P58304 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VSX2P58304 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VSX2P58304 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VSX2P58304 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VSX2P58304 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VSX2P58304 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VSX2P58304 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VSX2P58304 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VSX2P58304 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VSX2P58304 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VSX2P58304 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VSX2P58304 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VSX2P58304 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VSX2P58304 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VSX2P58304 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VSX2P58304 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VSX2P58304 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VSX2P58304 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VSX2P58304 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VSX2P58304 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VSX2P58304 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VSX2P58304 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VSX2P58304 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VSX2P58304 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VSX2P58304 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VSX2P58304 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VSX2P58304 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VSX2P58304 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VSX2P58304 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VSX2P58304 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VSX2P58304 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VSX2P58304 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VSX2P58304 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VSX2P58304 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VSX2P58304 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VSX2P58304 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VSX2P58304 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VSX2P58304 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VSX2P58304 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VSX2P58304 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VSX2P58304 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VSX2P58304 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VSX2P58304 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VSX2P58304 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VSX2P58304 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VSX2P58304 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VSX2P58304 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VSX2P58304 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VSX2P58304 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VSX2P58304 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VSX2P58304 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VSX2P58304 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VSX2P58304 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VSX2P58304 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VSX2P58304 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VSX2P58304 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VSX2P58304 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VSX2P58304 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VSX2P58304 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms