Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELLP55199 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELLP55199 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELLP55199 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELLP55199 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELLP55199 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELLP55199 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ELLP55199 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELLP55199 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELLP55199 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELLP55199 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELLP55199 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELLP55199 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELLP55199 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELLP55199 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELLP55199 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELLP55199 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELLP55199 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ELLP55199 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ELLP55199 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ELLP55199 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ELLP55199 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ELLP55199 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ELLP55199 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ELLP55199 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELLP55199 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELLP55199 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELLP55199 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELLP55199 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELLP55199 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELLP55199 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELLP55199 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELLP55199 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELLP55199 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELLP55199 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELLP55199 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELLP55199 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELLP55199 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELLP55199 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ELLP55199 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ELLP55199 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ELLP55199 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELLP55199 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELLP55199 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELLP55199 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELLP55199 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELLP55199 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELLP55199 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELLP55199 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELLP55199 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELLP55199 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELLP55199 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELLP55199 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELLP55199 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELLP55199 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELLP55199 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELLP55199 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELLP55199 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ELLP55199 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ELLP55199 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ELLP55199 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ELLP55199 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ELLP55199 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ELLP55199 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ELLP55199 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ELLP55199 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ELLP55199 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ELLP55199 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ELLP55199 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ELLP55199 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ELLP55199 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ELLP55199 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ELLP55199 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ELLP55199 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ELLP55199 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ELLP55199 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ELLP55199 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ELLP55199 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ELLP55199 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ELLP55199 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ELLP55199 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ELLP55199 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ELLP55199 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ELLP55199 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ELLP55199 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ELLP55199 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELLP55199 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ELLP55199 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELLP55199 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELLP55199 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELLP55199 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELLP55199 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ELLP55199 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELLP55199 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELLP55199 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELLP55199 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELLP55199 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELLP55199 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELLP55199 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELLP55199 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms