Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms