Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms