Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DAP3P51398 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DAP3P51398 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DAP3P51398 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DAP3P51398 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DAP3P51398 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DAP3P51398 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DAP3P51398 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DAP3P51398 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DAP3P51398 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DAP3P51398 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DAP3P51398 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DAP3P51398 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DAP3P51398 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DAP3P51398 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DAP3P51398 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DAP3P51398 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DAP3P51398 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DAP3P51398 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DAP3P51398 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DAP3P51398 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DAP3P51398 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DAP3P51398 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DAP3P51398 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DAP3P51398 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DAP3P51398 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DAP3P51398 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DAP3P51398 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DAP3P51398 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DAP3P51398 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DAP3P51398 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DAP3P51398 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DAP3P51398 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DAP3P51398 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DAP3P51398 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DAP3P51398 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DAP3P51398 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DAP3P51398 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DAP3P51398 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DAP3P51398 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DAP3P51398 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DAP3P51398 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DAP3P51398 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DAP3P51398 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DAP3P51398 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DAP3P51398 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DAP3P51398 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DAP3P51398 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DAP3P51398 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DAP3P51398 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DAP3P51398 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DAP3P51398 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DAP3P51398 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DAP3P51398 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DAP3P51398 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DAP3P51398 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DAP3P51398 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DAP3P51398 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DAP3P51398 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DAP3P51398 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DAP3P51398 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DAP3P51398 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DAP3P51398 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DAP3P51398 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DAP3P51398 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DAP3P51398 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DAP3P51398 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DAP3P51398 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DAP3P51398 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DAP3P51398 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DAP3P51398 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DAP3P51398 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DAP3P51398 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DAP3P51398 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DAP3P51398 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DAP3P51398 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DAP3P51398 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DAP3P51398 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DAP3P51398 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DAP3P51398 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DAP3P51398 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DAP3P51398 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DAP3P51398 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DAP3P51398 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DAP3P51398 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DAP3P51398 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DAP3P51398 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DAP3P51398 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DAP3P51398 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DAP3P51398 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DAP3P51398 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DAP3P51398 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
DAP3P51398 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DAP3P51398 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DAP3P51398 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DAP3P51398 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DAP3P51398 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DAP3P51398 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DAP3P51398 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DAP3P51398 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms