Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ETV1P50549 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ETV1P50549 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ETV1P50549 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ETV1P50549 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ETV1P50549 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ETV1P50549 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ETV1P50549 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ETV1P50549 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ETV1P50549 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ETV1P50549 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ETV1P50549 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ETV1P50549 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ETV1P50549 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ETV1P50549 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ETV1P50549 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ETV1P50549 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ETV1P50549 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ETV1P50549 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ETV1P50549 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ETV1P50549 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ETV1P50549 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ETV1P50549 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ETV1P50549 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ETV1P50549 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ETV1P50549 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ETV1P50549 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ETV1P50549 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ETV1P50549 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ETV1P50549 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ETV1P50549 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ETV1P50549 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ETV1P50549 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ETV1P50549 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ETV1P50549 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ETV1P50549 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ETV1P50549 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ETV1P50549 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ETV1P50549 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ETV1P50549 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ETV1P50549 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ETV1P50549 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ETV1P50549 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ETV1P50549 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ETV1P50549 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ETV1P50549 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ETV1P50549 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ETV1P50549 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ETV1P50549 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ETV1P50549 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ETV1P50549 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ETV1P50549 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ETV1P50549 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ETV1P50549 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ETV1P50549 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ETV1P50549 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ETV1P50549 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ETV1P50549 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ETV1P50549 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ETV1P50549 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ETV1P50549 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ETV1P50549 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ETV1P50549 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ETV1P50549 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ETV1P50549 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ETV1P50549 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ETV1P50549 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ETV1P50549 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ETV1P50549 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ETV1P50549 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ETV1P50549 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ETV1P50549 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ETV1P50549 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ETV1P50549 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ETV1P50549 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ETV1P50549 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ETV1P50549 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ETV1P50549 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ETV1P50549 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ETV1P50549 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ETV1P50549 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ETV1P50549 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ETV1P50549 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ETV1P50549 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ETV1P50549 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ETV1P50549 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ETV1P50549 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ETV1P50549 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ETV1P50549 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ETV1P50549 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ETV1P50549 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ETV1P50549 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ETV1P50549 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ETV1P50549 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ETV1P50549 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ETV1P50549 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ETV1P50549 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ETV1P50549 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ETV1P50549 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ETV1P50549 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms