Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GSK3BP49841 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms