Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms