Protein–RNA interactions for Protein: P49711

CTCF, Transcriptional repressor CTCF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCFP49711 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTCFP49711 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTCFP49711 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTCFP49711 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTCFP49711 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTCFP49711 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTCFP49711 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTCFP49711 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTCFP49711 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTCFP49711 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTCFP49711 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTCFP49711 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTCFP49711 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTCFP49711 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTCFP49711 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTCFP49711 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTCFP49711 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTCFP49711 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTCFP49711 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTCFP49711 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTCFP49711 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTCFP49711 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTCFP49711 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTCFP49711 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTCFP49711 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CTCFP49711 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTCFP49711 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTCFP49711 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTCFP49711 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTCFP49711 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTCFP49711 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTCFP49711 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTCFP49711 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTCFP49711 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTCFP49711 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTCFP49711 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTCFP49711 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTCFP49711 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTCFP49711 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTCFP49711 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTCFP49711 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTCFP49711 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTCFP49711 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTCFP49711 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTCFP49711 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CTCFP49711 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTCFP49711 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTCFP49711 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTCFP49711 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTCFP49711 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CTCFP49711 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTCFP49711 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTCFP49711 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTCFP49711 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTCFP49711 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTCFP49711 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTCFP49711 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTCFP49711 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTCFP49711 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTCFP49711 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTCFP49711 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTCFP49711 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTCFP49711 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTCFP49711 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTCFP49711 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CTCFP49711 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTCFP49711 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTCFP49711 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTCFP49711 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTCFP49711 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTCFP49711 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTCFP49711 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTCFP49711 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTCFP49711 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTCFP49711 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTCFP49711 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTCFP49711 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTCFP49711 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTCFP49711 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CTCFP49711 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTCFP49711 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTCFP49711 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTCFP49711 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTCFP49711 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTCFP49711 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTCFP49711 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CTCFP49711 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTCFP49711 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTCFP49711 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTCFP49711 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTCFP49711 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CTCFP49711 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CTCFP49711 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTCFP49711 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTCFP49711 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTCFP49711 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CTCFP49711 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTCFP49711 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTCFP49711 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTCFP49711 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms