Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TTPAP49638 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TTPAP49638 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTPAP49638 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTPAP49638 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTPAP49638 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTPAP49638 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTPAP49638 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTPAP49638 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTPAP49638 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTPAP49638 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTPAP49638 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTPAP49638 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTPAP49638 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTPAP49638 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TTPAP49638 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTPAP49638 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTPAP49638 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTPAP49638 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TTPAP49638 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTPAP49638 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTPAP49638 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTPAP49638 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTPAP49638 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTPAP49638 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTPAP49638 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTPAP49638 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTPAP49638 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTPAP49638 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTPAP49638 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTPAP49638 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTPAP49638 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTPAP49638 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTPAP49638 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTPAP49638 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTPAP49638 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTPAP49638 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTPAP49638 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTPAP49638 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTPAP49638 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTPAP49638 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTPAP49638 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTPAP49638 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTPAP49638 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTPAP49638 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTPAP49638 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTPAP49638 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTPAP49638 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTPAP49638 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTPAP49638 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTPAP49638 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTPAP49638 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTPAP49638 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTPAP49638 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTPAP49638 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTPAP49638 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TTPAP49638 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTPAP49638 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTPAP49638 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTPAP49638 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTPAP49638 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTPAP49638 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTPAP49638 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTPAP49638 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTPAP49638 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTPAP49638 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTPAP49638 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTPAP49638 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTPAP49638 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTPAP49638 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTPAP49638 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTPAP49638 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTPAP49638 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTPAP49638 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTPAP49638 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TTPAP49638 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTPAP49638 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTPAP49638 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTPAP49638 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTPAP49638 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTPAP49638 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTPAP49638 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTPAP49638 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTPAP49638 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTPAP49638 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTPAP49638 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTPAP49638 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTPAP49638 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTPAP49638 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTPAP49638 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTPAP49638 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTPAP49638 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTPAP49638 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTPAP49638 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTPAP49638 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTPAP49638 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTPAP49638 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTPAP49638 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTPAP49638 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTPAP49638 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
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