Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FNTAP49354 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FNTAP49354 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FNTAP49354 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FNTAP49354 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FNTAP49354 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FNTAP49354 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FNTAP49354 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FNTAP49354 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FNTAP49354 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FNTAP49354 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FNTAP49354 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FNTAP49354 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FNTAP49354 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FNTAP49354 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FNTAP49354 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FNTAP49354 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FNTAP49354 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FNTAP49354 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FNTAP49354 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FNTAP49354 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FNTAP49354 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FNTAP49354 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FNTAP49354 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FNTAP49354 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FNTAP49354 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FNTAP49354 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FNTAP49354 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FNTAP49354 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FNTAP49354 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FNTAP49354 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FNTAP49354 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FNTAP49354 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FNTAP49354 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FNTAP49354 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FNTAP49354 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FNTAP49354 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FNTAP49354 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FNTAP49354 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FNTAP49354 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FNTAP49354 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FNTAP49354 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FNTAP49354 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FNTAP49354 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FNTAP49354 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FNTAP49354 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FNTAP49354 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FNTAP49354 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FNTAP49354 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FNTAP49354 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FNTAP49354 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FNTAP49354 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FNTAP49354 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FNTAP49354 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FNTAP49354 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FNTAP49354 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FNTAP49354 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FNTAP49354 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FNTAP49354 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FNTAP49354 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FNTAP49354 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FNTAP49354 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FNTAP49354 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FNTAP49354 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FNTAP49354 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FNTAP49354 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FNTAP49354 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FNTAP49354 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FNTAP49354 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FNTAP49354 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FNTAP49354 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FNTAP49354 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FNTAP49354 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FNTAP49354 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FNTAP49354 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FNTAP49354 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FNTAP49354 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FNTAP49354 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FNTAP49354 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FNTAP49354 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNTAP49354 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNTAP49354 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNTAP49354 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNTAP49354 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNTAP49354 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNTAP49354 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNTAP49354 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNTAP49354 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNTAP49354 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNTAP49354 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNTAP49354 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNTAP49354 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNTAP49354 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNTAP49354 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNTAP49354 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNTAP49354 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FNTAP49354 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FNTAP49354 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
FNTAP49354 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FNTAP49354 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms