Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POU3F4P49335 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
POU3F4P49335 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POU3F4P49335 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POU3F4P49335 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POU3F4P49335 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POU3F4P49335 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POU3F4P49335 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
POU3F4P49335 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POU3F4P49335 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POU3F4P49335 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POU3F4P49335 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POU3F4P49335 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POU3F4P49335 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POU3F4P49335 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
POU3F4P49335 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POU3F4P49335 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POU3F4P49335 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POU3F4P49335 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POU3F4P49335 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POU3F4P49335 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POU3F4P49335 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POU3F4P49335 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POU3F4P49335 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POU3F4P49335 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POU3F4P49335 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POU3F4P49335 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POU3F4P49335 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POU3F4P49335 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POU3F4P49335 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POU3F4P49335 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POU3F4P49335 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POU3F4P49335 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
POU3F4P49335 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POU3F4P49335 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POU3F4P49335 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
POU3F4P49335 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
POU3F4P49335 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
POU3F4P49335 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POU3F4P49335 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POU3F4P49335 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POU3F4P49335 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POU3F4P49335 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POU3F4P49335 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POU3F4P49335 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POU3F4P49335 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POU3F4P49335 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POU3F4P49335 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POU3F4P49335 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POU3F4P49335 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POU3F4P49335 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POU3F4P49335 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
POU3F4P49335 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
POU3F4P49335 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
POU3F4P49335 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
POU3F4P49335 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
POU3F4P49335 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
POU3F4P49335 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
POU3F4P49335 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
POU3F4P49335 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms