Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AFMP43652 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AFMP43652 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AFMP43652 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AFMP43652 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
AFMP43652 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AFMP43652 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
AFMP43652 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AFMP43652 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
AFMP43652 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AFMP43652 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AFMP43652 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AFMP43652 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AFMP43652 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AFMP43652 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AFMP43652 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AFMP43652 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AFMP43652 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AFMP43652 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
AFMP43652 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AFMP43652 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AFMP43652 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AFMP43652 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AFMP43652 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
AFMP43652 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AFMP43652 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AFMP43652 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AFMP43652 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AFMP43652 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AFMP43652 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AFMP43652 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AFMP43652 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AFMP43652 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AFMP43652 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AFMP43652 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AFMP43652 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
AFMP43652 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AFMP43652 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AFMP43652 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AFMP43652 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AFMP43652 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AFMP43652 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AFMP43652 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AFMP43652 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AFMP43652 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AFMP43652 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AFMP43652 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AFMP43652 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AFMP43652 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AFMP43652 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AFMP43652 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
AFMP43652 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AFMP43652 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AFMP43652 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AFMP43652 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AFMP43652 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AFMP43652 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AFMP43652 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AFMP43652 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AFMP43652 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AFMP43652 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AFMP43652 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AFMP43652 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AFMP43652 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AFMP43652 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AFMP43652 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AFMP43652 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
AFMP43652 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AFMP43652 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AFMP43652 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
AFMP43652 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AFMP43652 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AFMP43652 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AFMP43652 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AFMP43652 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AFMP43652 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AFMP43652 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
AFMP43652 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
AFMP43652 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AFMP43652 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AFMP43652 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AFMP43652 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AFMP43652 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AFMP43652 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
AFMP43652 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
AFMP43652 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AFMP43652 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AFMP43652 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AFMP43652 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AFMP43652 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AFMP43652 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AFMP43652 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AFMP43652 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AFMP43652 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AFMP43652 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AFMP43652 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AFMP43652 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AFMP43652 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AFMP43652 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AFMP43652 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms