Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NR4A2P43354 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms