Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCAMP43121 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCAMP43121 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCAMP43121 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCAMP43121 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCAMP43121 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MCAMP43121 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCAMP43121 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCAMP43121 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCAMP43121 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCAMP43121 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCAMP43121 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCAMP43121 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCAMP43121 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCAMP43121 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCAMP43121 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCAMP43121 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCAMP43121 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCAMP43121 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCAMP43121 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCAMP43121 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCAMP43121 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MCAMP43121 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCAMP43121 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCAMP43121 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCAMP43121 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCAMP43121 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCAMP43121 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCAMP43121 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
MCAMP43121 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCAMP43121 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCAMP43121 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCAMP43121 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCAMP43121 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCAMP43121 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCAMP43121 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCAMP43121 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCAMP43121 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCAMP43121 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCAMP43121 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MCAMP43121 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCAMP43121 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCAMP43121 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCAMP43121 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCAMP43121 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCAMP43121 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCAMP43121 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCAMP43121 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCAMP43121 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCAMP43121 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCAMP43121 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCAMP43121 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MCAMP43121 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCAMP43121 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCAMP43121 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCAMP43121 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCAMP43121 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCAMP43121 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCAMP43121 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCAMP43121 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MCAMP43121 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCAMP43121 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCAMP43121 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCAMP43121 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCAMP43121 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCAMP43121 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCAMP43121 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCAMP43121 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCAMP43121 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCAMP43121 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCAMP43121 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCAMP43121 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCAMP43121 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCAMP43121 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCAMP43121 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCAMP43121 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCAMP43121 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCAMP43121 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCAMP43121 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCAMP43121 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCAMP43121 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MCAMP43121 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCAMP43121 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MCAMP43121 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCAMP43121 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCAMP43121 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCAMP43121 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCAMP43121 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCAMP43121 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCAMP43121 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCAMP43121 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCAMP43121 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MCAMP43121 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCAMP43121 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCAMP43121 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCAMP43121 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCAMP43121 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCAMP43121 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCAMP43121 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCAMP43121 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms