Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ITGAEP38570 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ITGAEP38570 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms