Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNCAP37840 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNCAP37840 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNCAP37840 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNCAP37840 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNCAP37840 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNCAP37840 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNCAP37840 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNCAP37840 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNCAP37840 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNCAP37840 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNCAP37840 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNCAP37840 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNCAP37840 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNCAP37840 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SNCAP37840 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNCAP37840 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SNCAP37840 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SNCAP37840 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SNCAP37840 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNCAP37840 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNCAP37840 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNCAP37840 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNCAP37840 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNCAP37840 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNCAP37840 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNCAP37840 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNCAP37840 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNCAP37840 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNCAP37840 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNCAP37840 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNCAP37840 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNCAP37840 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNCAP37840 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNCAP37840 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNCAP37840 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNCAP37840 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNCAP37840 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNCAP37840 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNCAP37840 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNCAP37840 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNCAP37840 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNCAP37840 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNCAP37840 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNCAP37840 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNCAP37840 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNCAP37840 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNCAP37840 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNCAP37840 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNCAP37840 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNCAP37840 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNCAP37840 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNCAP37840 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNCAP37840 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNCAP37840 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNCAP37840 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNCAP37840 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNCAP37840 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNCAP37840 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNCAP37840 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNCAP37840 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNCAP37840 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNCAP37840 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNCAP37840 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNCAP37840 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNCAP37840 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNCAP37840 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNCAP37840 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNCAP37840 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNCAP37840 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNCAP37840 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNCAP37840 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNCAP37840 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNCAP37840 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNCAP37840 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNCAP37840 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNCAP37840 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNCAP37840 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SNCAP37840 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNCAP37840 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNCAP37840 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNCAP37840 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNCAP37840 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNCAP37840 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNCAP37840 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNCAP37840 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNCAP37840 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNCAP37840 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SNCAP37840 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNCAP37840 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNCAP37840 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNCAP37840 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNCAP37840 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SNCAP37840 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNCAP37840 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNCAP37840 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNCAP37840 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNCAP37840 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNCAP37840 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNCAP37840 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms