Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms