Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXD13P35453 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD13P35453 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms