Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCKARP32238 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCKARP32238 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCKARP32238 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCKARP32238 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCKARP32238 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCKARP32238 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCKARP32238 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCKARP32238 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCKARP32238 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCKARP32238 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCKARP32238 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCKARP32238 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCKARP32238 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCKARP32238 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCKARP32238 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCKARP32238 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCKARP32238 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCKARP32238 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCKARP32238 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCKARP32238 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCKARP32238 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCKARP32238 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCKARP32238 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCKARP32238 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCKARP32238 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCKARP32238 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCKARP32238 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCKARP32238 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCKARP32238 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCKARP32238 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCKARP32238 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCKARP32238 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCKARP32238 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCKARP32238 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCKARP32238 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCKARP32238 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCKARP32238 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCKARP32238 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCKARP32238 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCKARP32238 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCKARP32238 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCKARP32238 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCKARP32238 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCKARP32238 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCKARP32238 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCKARP32238 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCKARP32238 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCKARP32238 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCKARP32238 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCKARP32238 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCKARP32238 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCKARP32238 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCKARP32238 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCKARP32238 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCKARP32238 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCKARP32238 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCKARP32238 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCKARP32238 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCKARP32238 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCKARP32238 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCKARP32238 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCKARP32238 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCKARP32238 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCKARP32238 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCKARP32238 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCKARP32238 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCKARP32238 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCKARP32238 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCKARP32238 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCKARP32238 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CCKARP32238 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCKARP32238 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCKARP32238 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCKARP32238 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCKARP32238 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCKARP32238 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCKARP32238 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCKARP32238 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCKARP32238 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCKARP32238 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCKARP32238 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCKARP32238 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCKARP32238 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCKARP32238 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCKARP32238 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCKARP32238 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCKARP32238 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCKARP32238 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCKARP32238 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCKARP32238 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCKARP32238 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCKARP32238 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCKARP32238 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCKARP32238 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCKARP32238 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCKARP32238 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCKARP32238 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCKARP32238 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCKARP32238 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 210.5 ms