Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HOXA7P31268 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA7P31268 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms