Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC27P30260 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC27P30260 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC27P30260 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC27P30260 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC27P30260 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC27P30260 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC27P30260 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC27P30260 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC27P30260 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC27P30260 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC27P30260 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC27P30260 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC27P30260 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC27P30260 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC27P30260 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC27P30260 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC27P30260 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC27P30260 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC27P30260 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC27P30260 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC27P30260 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC27P30260 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC27P30260 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC27P30260 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC27P30260 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC27P30260 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC27P30260 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC27P30260 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC27P30260 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC27P30260 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC27P30260 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC27P30260 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC27P30260 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC27P30260 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC27P30260 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC27P30260 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC27P30260 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC27P30260 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC27P30260 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC27P30260 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC27P30260 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC27P30260 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC27P30260 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC27P30260 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC27P30260 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC27P30260 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC27P30260 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC27P30260 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC27P30260 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC27P30260 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC27P30260 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC27P30260 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC27P30260 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC27P30260 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC27P30260 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC27P30260 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC27P30260 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC27P30260 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC27P30260 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC27P30260 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC27P30260 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC27P30260 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC27P30260 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC27P30260 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC27P30260 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC27P30260 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC27P30260 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC27P30260 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC27P30260 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC27P30260 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC27P30260 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC27P30260 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC27P30260 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC27P30260 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC27P30260 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC27P30260 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC27P30260 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC27P30260 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC27P30260 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC27P30260 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC27P30260 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC27P30260 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC27P30260 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC27P30260 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC27P30260 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC27P30260 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC27P30260 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC27P30260 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC27P30260 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC27P30260 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC27P30260 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC27P30260 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC27P30260 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC27P30260 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC27P30260 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC27P30260 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC27P30260 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC27P30260 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC27P30260 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms