Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP1P29466 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP1P29466 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP1P29466 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP1P29466 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP1P29466 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP1P29466 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP1P29466 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP1P29466 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP1P29466 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP1P29466 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP1P29466 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP1P29466 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP1P29466 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP1P29466 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP1P29466 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP1P29466 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP1P29466 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP1P29466 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP1P29466 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP1P29466 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP1P29466 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP1P29466 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP1P29466 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP1P29466 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP1P29466 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP1P29466 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP1P29466 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP1P29466 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP1P29466 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP1P29466 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP1P29466 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP1P29466 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP1P29466 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP1P29466 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP1P29466 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP1P29466 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP1P29466 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP1P29466 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP1P29466 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP1P29466 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP1P29466 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP1P29466 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP1P29466 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP1P29466 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP1P29466 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP1P29466 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP1P29466 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP1P29466 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP1P29466 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP1P29466 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP1P29466 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP1P29466 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP1P29466 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP1P29466 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP1P29466 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP1P29466 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP1P29466 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP1P29466 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP1P29466 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP1P29466 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP1P29466 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP1P29466 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP1P29466 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP1P29466 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP1P29466 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP1P29466 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP1P29466 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP1P29466 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP1P29466 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP1P29466 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP1P29466 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP1P29466 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP1P29466 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP1P29466 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP1P29466 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP1P29466 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP1P29466 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP1P29466 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP1P29466 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP1P29466 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP1P29466 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP1P29466 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP1P29466 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP1P29466 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP1P29466 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP1P29466 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP1P29466 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP1P29466 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP1P29466 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP1P29466 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP1P29466 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP1P29466 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP1P29466 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP1P29466 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP1P29466 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP1P29466 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP1P29466 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP1P29466 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP1P29466 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms