Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms