Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTFRP26992 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms