Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms