Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPREP23469 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPREP23469 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPREP23469 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPREP23469 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPREP23469 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPREP23469 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPREP23469 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPREP23469 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPREP23469 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPREP23469 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPREP23469 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPREP23469 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPREP23469 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPREP23469 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPREP23469 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPREP23469 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPREP23469 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPREP23469 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPREP23469 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPREP23469 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPREP23469 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPREP23469 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPREP23469 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPREP23469 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPREP23469 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPREP23469 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPREP23469 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPREP23469 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPREP23469 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPREP23469 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPREP23469 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPREP23469 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPREP23469 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPREP23469 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPREP23469 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPREP23469 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPREP23469 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPREP23469 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPREP23469 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPREP23469 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPREP23469 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPREP23469 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPREP23469 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPREP23469 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPREP23469 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPREP23469 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPREP23469 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPREP23469 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPREP23469 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPREP23469 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPREP23469 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPREP23469 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPREP23469 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPREP23469 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPREP23469 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPREP23469 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPREP23469 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPREP23469 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPREP23469 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPREP23469 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPREP23469 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPREP23469 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPREP23469 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPREP23469 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPREP23469 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPREP23469 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPREP23469 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPREP23469 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPREP23469 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPREP23469 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPREP23469 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPREP23469 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPREP23469 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPREP23469 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPREP23469 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPREP23469 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPREP23469 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPREP23469 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPREP23469 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPREP23469 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPREP23469 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPREP23469 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPREP23469 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPREP23469 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPREP23469 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPREP23469 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPREP23469 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPREP23469 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPREP23469 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPREP23469 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPREP23469 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPREP23469 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPREP23469 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPREP23469 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPREP23469 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPREP23469 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPREP23469 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPREP23469 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPREP23469 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
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