Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FGFR4P22455 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FGFR4P22455 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FGFR4P22455 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FGFR4P22455 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FGFR4P22455 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FGFR4P22455 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FGFR4P22455 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FGFR4P22455 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FGFR4P22455 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FGFR4P22455 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FGFR4P22455 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FGFR4P22455 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FGFR4P22455 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FGFR4P22455 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FGFR4P22455 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FGFR4P22455 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FGFR4P22455 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FGFR4P22455 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FGFR4P22455 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FGFR4P22455 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FGFR4P22455 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FGFR4P22455 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGFR4P22455 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FGFR4P22455 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FGFR4P22455 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGFR4P22455 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGFR4P22455 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
FGFR4P22455 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FGFR4P22455 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
FGFR4P22455 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FGFR4P22455 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGFR4P22455 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FGFR4P22455 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FGFR4P22455 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGFR4P22455 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGFR4P22455 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGFR4P22455 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FGFR4P22455 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FGFR4P22455 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FGFR4P22455 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FGFR4P22455 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FGFR4P22455 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FGFR4P22455 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FGFR4P22455 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FGFR4P22455 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FGFR4P22455 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FGFR4P22455 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FGFR4P22455 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FGFR4P22455 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FGFR4P22455 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FGFR4P22455 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FGFR4P22455 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FGFR4P22455 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FGFR4P22455 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FGFR4P22455 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
FGFR4P22455 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FGFR4P22455 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FGFR4P22455 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FGFR4P22455 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FGFR4P22455 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FGFR4P22455 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FGFR4P22455 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGFR4P22455 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FGFR4P22455 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGFR4P22455 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FGFR4P22455 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGFR4P22455 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGFR4P22455 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FGFR4P22455 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FGFR4P22455 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGFR4P22455 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGFR4P22455 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FGFR4P22455 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGFR4P22455 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
FGFR4P22455 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FGFR4P22455 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FGFR4P22455 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FGFR4P22455 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FGFR4P22455 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FGFR4P22455 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FGFR4P22455 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FGFR4P22455 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FGFR4P22455 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGFR4P22455 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGFR4P22455 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FGFR4P22455 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FGFR4P22455 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGFR4P22455 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FGFR4P22455 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
FGFR4P22455 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGFR4P22455 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGFR4P22455 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGFR4P22455 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGFR4P22455 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGFR4P22455 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGFR4P22455 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGFR4P22455 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
FGFR4P22455 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FGFR4P22455 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms