Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms