Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB5AP20339 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB5AP20339 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB5AP20339 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB5AP20339 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB5AP20339 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB5AP20339 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB5AP20339 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB5AP20339 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB5AP20339 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB5AP20339 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB5AP20339 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB5AP20339 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB5AP20339 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB5AP20339 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAB5AP20339 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB5AP20339 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB5AP20339 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB5AP20339 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB5AP20339 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RAB5AP20339 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB5AP20339 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB5AP20339 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RAB5AP20339 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB5AP20339 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RAB5AP20339 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB5AP20339 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB5AP20339 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB5AP20339 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB5AP20339 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB5AP20339 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB5AP20339 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB5AP20339 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB5AP20339 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB5AP20339 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB5AP20339 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB5AP20339 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RAB5AP20339 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB5AP20339 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB5AP20339 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB5AP20339 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB5AP20339 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB5AP20339 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB5AP20339 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB5AP20339 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB5AP20339 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB5AP20339 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB5AP20339 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB5AP20339 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB5AP20339 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB5AP20339 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RAB5AP20339 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB5AP20339 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB5AP20339 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB5AP20339 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB5AP20339 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB5AP20339 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB5AP20339 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB5AP20339 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB5AP20339 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB5AP20339 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB5AP20339 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB5AP20339 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB5AP20339 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB5AP20339 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB5AP20339 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB5AP20339 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB5AP20339 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB5AP20339 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAB5AP20339 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB5AP20339 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB5AP20339 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB5AP20339 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAB5AP20339 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB5AP20339 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAB5AP20339 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB5AP20339 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB5AP20339 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB5AP20339 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB5AP20339 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB5AP20339 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB5AP20339 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB5AP20339 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB5AP20339 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB5AP20339 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB5AP20339 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB5AP20339 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB5AP20339 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB5AP20339 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB5AP20339 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB5AP20339 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB5AP20339 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB5AP20339 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB5AP20339 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB5AP20339 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB5AP20339 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB5AP20339 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB5AP20339 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB5AP20339 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB5AP20339 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms