Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL3P19876 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms