Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CAPN2P17655 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN2P17655 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms