Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB9P17482 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms