Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD44P16070 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD44P16070 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CD44P16070 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CD44P16070 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD44P16070 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD44P16070 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD44P16070 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD44P16070 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD44P16070 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD44P16070 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD44P16070 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD44P16070 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD44P16070 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD44P16070 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD44P16070 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD44P16070 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD44P16070 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD44P16070 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD44P16070 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD44P16070 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD44P16070 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD44P16070 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD44P16070 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD44P16070 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD44P16070 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD44P16070 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD44P16070 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD44P16070 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD44P16070 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD44P16070 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CD44P16070 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD44P16070 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD44P16070 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD44P16070 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD44P16070 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD44P16070 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD44P16070 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD44P16070 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD44P16070 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD44P16070 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD44P16070 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD44P16070 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD44P16070 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD44P16070 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD44P16070 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD44P16070 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD44P16070 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD44P16070 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CD44P16070 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CD44P16070 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD44P16070 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD44P16070 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD44P16070 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD44P16070 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD44P16070 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD44P16070 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD44P16070 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD44P16070 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD44P16070 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CD44P16070 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CD44P16070 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CD44P16070 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CD44P16070 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CD44P16070 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CD44P16070 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CD44P16070 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CD44P16070 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD44P16070 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD44P16070 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD44P16070 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD44P16070 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD44P16070 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD44P16070 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD44P16070 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD44P16070 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD44P16070 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD44P16070 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CD44P16070 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD44P16070 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD44P16070 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD44P16070 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD44P16070 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD44P16070 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD44P16070 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD44P16070 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD44P16070 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD44P16070 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD44P16070 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD44P16070 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD44P16070 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD44P16070 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD44P16070 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD44P16070 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD44P16070 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD44P16070 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD44P16070 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD44P16070 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD44P16070 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD44P16070 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms