Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
VEGFAP15692 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VEGFAP15692 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms