Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLA-DOBP13765 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms