Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DEFA4P12838 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DEFA4P12838 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
DEFA4P12838 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
DEFA4P12838 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DEFA4P12838 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DEFA4P12838 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
DEFA4P12838 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
DEFA4P12838 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEFA4P12838 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEFA4P12838 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEFA4P12838 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEFA4P12838 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEFA4P12838 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEFA4P12838 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEFA4P12838 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEFA4P12838 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEFA4P12838 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DEFA4P12838 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEFA4P12838 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEFA4P12838 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEFA4P12838 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEFA4P12838 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEFA4P12838 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEFA4P12838 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEFA4P12838 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEFA4P12838 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEFA4P12838 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEFA4P12838 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEFA4P12838 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEFA4P12838 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEFA4P12838 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEFA4P12838 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEFA4P12838 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEFA4P12838 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEFA4P12838 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEFA4P12838 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DEFA4P12838 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DEFA4P12838 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DEFA4P12838 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DEFA4P12838 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
DEFA4P12838 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DEFA4P12838 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DEFA4P12838 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DEFA4P12838 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DEFA4P12838 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DEFA4P12838 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DEFA4P12838 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DEFA4P12838 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms