Protein–RNA interactions for Protein: P12319

FCER1A, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCER1AP12319 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FCER1AP12319 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FCER1AP12319 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FCER1AP12319 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FCER1AP12319 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FCER1AP12319 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms