Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPRP12270 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPRP12270 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPRP12270 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPRP12270 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPRP12270 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPRP12270 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPRP12270 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPRP12270 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TPRP12270 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TPRP12270 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPRP12270 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPRP12270 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPRP12270 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPRP12270 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPRP12270 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPRP12270 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPRP12270 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPRP12270 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPRP12270 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPRP12270 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPRP12270 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPRP12270 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TPRP12270 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPRP12270 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPRP12270 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPRP12270 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPRP12270 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPRP12270 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPRP12270 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPRP12270 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPRP12270 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TPRP12270 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TPRP12270 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPRP12270 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPRP12270 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPRP12270 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TPRP12270 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPRP12270 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPRP12270 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TPRP12270 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPRP12270 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPRP12270 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPRP12270 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPRP12270 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPRP12270 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPRP12270 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPRP12270 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPRP12270 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPRP12270 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPRP12270 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPRP12270 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPRP12270 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPRP12270 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPRP12270 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPRP12270 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPRP12270 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPRP12270 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPRP12270 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPRP12270 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPRP12270 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPRP12270 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPRP12270 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPRP12270 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TPRP12270 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPRP12270 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPRP12270 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPRP12270 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPRP12270 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPRP12270 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPRP12270 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPRP12270 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPRP12270 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPRP12270 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPRP12270 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TPRP12270 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPRP12270 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TPRP12270 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPRP12270 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TPRP12270 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPRP12270 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPRP12270 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPRP12270 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TPRP12270 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TPRP12270 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TPRP12270 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TPRP12270 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TPRP12270 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TPRP12270 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TPRP12270 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TPRP12270 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TPRP12270 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TPRP12270 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TPRP12270 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TPRP12270 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TPRP12270 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TPRP12270 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TPRP12270 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TPRP12270 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TPRP12270 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms