Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LAMC1P11047 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms