Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GLI4P10075 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GLI4P10075 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GLI4P10075 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GLI4P10075 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GLI4P10075 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GLI4P10075 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GLI4P10075 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GLI4P10075 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GLI4P10075 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GLI4P10075 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GLI4P10075 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GLI4P10075 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GLI4P10075 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GLI4P10075 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GLI4P10075 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GLI4P10075 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GLI4P10075 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GLI4P10075 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GLI4P10075 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GLI4P10075 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GLI4P10075 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GLI4P10075 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GLI4P10075 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GLI4P10075 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GLI4P10075 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GLI4P10075 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GLI4P10075 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GLI4P10075 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GLI4P10075 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GLI4P10075 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GLI4P10075 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GLI4P10075 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GLI4P10075 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GLI4P10075 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GLI4P10075 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GLI4P10075 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GLI4P10075 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GLI4P10075 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GLI4P10075 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GLI4P10075 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GLI4P10075 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GLI4P10075 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GLI4P10075 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GLI4P10075 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GLI4P10075 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GLI4P10075 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GLI4P10075 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GLI4P10075 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GLI4P10075 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GLI4P10075 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GLI4P10075 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GLI4P10075 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GLI4P10075 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GLI4P10075 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GLI4P10075 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GLI4P10075 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GLI4P10075 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GLI4P10075 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GLI4P10075 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GLI4P10075 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GLI4P10075 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GLI4P10075 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GLI4P10075 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GLI4P10075 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GLI4P10075 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GLI4P10075 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GLI4P10075 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GLI4P10075 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GLI4P10075 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GLI4P10075 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GLI4P10075 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GLI4P10075 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GLI4P10075 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GLI4P10075 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GLI4P10075 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GLI4P10075 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GLI4P10075 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GLI4P10075 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GLI4P10075 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GLI4P10075 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GLI4P10075 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GLI4P10075 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GLI4P10075 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GLI4P10075 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GLI4P10075 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GLI4P10075 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GLI4P10075 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GLI4P10075 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GLI4P10075 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GLI4P10075 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GLI4P10075 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GLI4P10075 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GLI4P10075 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GLI4P10075 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GLI4P10075 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GLI4P10075 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GLI4P10075 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GLI4P10075 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GLI4P10075 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms