Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA2

VSIG8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG8P0DPA2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms